佛教主张因果报应，将人世间发生的关系分为四种：报恩的、报怨的、讨债的、还债的（可能有人认为还存在一种没什么关系的情况，如有些人老死不相往来，但从系统论的观点看，任何生物之间都是会发生关系的，只是有的是直接相关，有的是间接相关 ），当然这四种关系只是由各方前世所造的业所形成的一种初始配置，是一种暂时的短期的均衡，会由于今世所造的业（业包括善业、恶业和无所谓善恶的无记业）而相互转化。
佛教认为生命有三世：过去世、现在世和未来世，因果循环就在这三世中不断地绵延。佛教中人常说一句话：“欲知过去因，今生受者是；欲知未来果，今生作者是。”
有很多人没有理解这句话的真正含义，就自以为是地开始向三世因果说展开批判，认为这是胡说八道，是糊弄人，典型的就是举出南京大屠杀之类的例子，认为佛教的三世因果说不能给出一个让人满意的解释，因为按照佛教说法，日本人屠杀中国人那就是因为中国人前世曾经屠杀过日本人欠过债，今天他们来讨债就应该无条件归还，而不是积极抵抗。
这其实是没有真正弄懂三世因果理论。就拿南京大屠杀来说，日本人屠杀中国人，这是果，有果必然有因，既有今世的因（如日本军国主义扩张侵略成性），按照佛教理论来讲，也应该有前世的因，也就被屠杀的中国人前世一定和屠杀者发生过关系。可是注意！前世的因并不一定就是中国人前世屠杀过日本人！完全可能是这样的情况，比如说前世有两个人，某甲和某乙，某甲善待某乙，如无偿资助某乙，结果某乙是个不懂得感恩的白眼狼（就像海清同学那种人），某甲不悦，停止资助，某乙便怀恨在心，找机会报复，而且嗔恨的习气越来越重。到了这一世，某甲做了南京人，某乙做了日本人，受其习气驱使，侵入南京将某甲杀了。对某甲来说，被屠杀就是今生的果，这个果有其前世的因，但前世因并不是自己造了恶业。迄今为止的整个过程中某甲并没有对某乙造什么恶业，反而却遭到了厄运。这是不是就否定了三世因果说呢？不是，因为未来世还没有说到。三世实际上是条无尽的时间长河，某乙尽管没有在过去世因抱怨某甲而受报，也没有在今世因屠杀某甲而受报，但这只是因为其受恶报的缘还没有成熟，一旦缘成熟（因为未来世是无限多的，所以总有缘成熟的一天），某乙必在将来的某一世因所造恶业而受报，而且拖欠的时间越长，连本带息欠某甲的债也就越多，将来受恶报也就越重。同样道理，某乙也定会在将来的某一世因为缘的成熟而得到善报。所谓“善有善报，恶有恶报；不是不报，时候未到。”
有人可能会问：某乙过去世是个以怨报恩的白眼狼，怎么今世还能转生为人？这不是与佛教所说的矛盾吗？其实不矛盾。过去世还有过去世，某乙所以能在最近两世转世为人，其实是因为他在过去世的过去世修过不少善业，所以得此善报，而且其善业还不一定报完了，如果没有报完，下辈子还可能托生善道，但其善业总有报完的一天，一旦报完，恶业就开始起主导作用，恶报就临头了。所谓“善恶到头都有报，只争来早与来迟。”
某乙既然欠下了某甲的债，自然是要归还的。注意归还欠债可以有不同的形式，可能是某乙做了畜牲，被某甲从菜市场买来杀了；也可能是某甲将来将某乙误杀了（如某乙变成蚂蚁被某甲无心踩死）；当然也可能是在将来某甲某乙都是人身的某一世某甲受业驱使将某乙杀害（如果某甲蓄意杀人，可能在世间触犯刑法造成犯罪，应该受到法律制裁，这个后面再解释），这几种还债方式不管是哪一种，都很难将恩怨了结，因为某乙并不记得自己曾欠过某甲的命债，并不认为自己还债是理所当然的，所以被杀后还会找机会报复，这样就造成冤冤相报无有穷的恶性循环。当然还可能有一种还债方式，那就是某甲不计前仇（这可以说是一种善业），结果生入善道享福，某乙却仍不肯悔过，结果堕入地狱受苦。不过这还不是彻底的解决之道，最理想的办法是某甲修学佛法，将善业作为成佛的资粮，某乙也修学佛法，忏悔自己往昔的罪业，最终都成佛，将一切恩怨彻底化解。
根据上面所假设的，南京大屠杀完全可能是日本人单方面在造作恶业，而不是中国人曾欠过日本人什么。如果是这样，中国人当然要抵抗侵略，因为这时候积极抵抗侵略就是抵抗妖魔，就是防止日本人作更多的恶业将来受更大的苦报，既是在拯救中国人，又是在挽救日本人，是以大慈悲心在行大菩萨道。不过也还存在一种可能，那就是，被屠杀的中国人以前确实曾欠日本人的，比如说，以前的某一世，日本人在畜牲道，是某种动物，比如狗，一群中国人将其屠杀了，后来这群中国人由于共业生在了南京，那群狗也由于共业生在同时代的日本为人（这是完全可能的，因为前面说过，以前的好多世他们也可能积累过善业还没有报完），于是日本人就要讨债报仇，动起刀兵（佛教有言：欲问世上刀兵劫难，且听屠门夜半声）。但是, 侵略屠杀使世界充满血腥和暴力，并不是一种正当的讨债方式，因为这种方式会导致滥杀无辜，陷生灵于水火之中，用经济学的术语来说，就是有很大的负的外在性。更何况，世界上大部分人并不知道欠债的前因后果，如果这种侵略屠杀的讨债方式被合理化，天下的恶人都会以此为借口去侵略他人屠杀他人，这样侵略者所造的罪业也就罄竹难书了。
所以，侵略屠杀不管是不是因为被侵略者前世欠了债，这种野蛮行为都是要强烈谴责的人，都是应该积极抵抗的；抵抗侵略者就是在阻止侵略者造恶业，自己就是在造善业。正信的佛教徒绝对不会说因为欠了债就要还债就不去抵抗侵略。事实上，根据前面的分析，只要是侵略屠杀，就是在造恶业，就是魔行，就应该被否定。这正如不管是不是因为别人欠了其债，只要是谋财害命，就是在造恶业，就是魔行，就应该受到法律的惩处。对于这些魔行，佛菩萨是不可能坐视不管的。在群魔乱舞的时候，佛也是要作狮子吼的。佛菩萨无心，以众生之心为心。佛经上讲了，当魔现于世的时候，佛菩萨或者化作比丘身（如当年参加抗日战争的僧兵），或者化作居士身，或者化作宰官身……总之，随机而化，来降妖伏魔。所以当年积极抵抗日寇侵略的军人、工人、农民、知识分子很多都是佛菩萨的化身，是佛菩萨显凡夫相而作狮子吼。当然，也有一些本是凡夫，因为抗战而接近菩萨的层次——前面说过，抵抗侵略本身就是大慈大悲，就是在修菩萨行。
至此，说佛菩萨在抵抗侵略的年代无所作为的说法已经不攻自破，因为一切抵抗者都是菩萨（包括再来的圣人菩萨与自觉抵抗的凡夫菩萨）。但是还剩下最后一个问题，那就是“欲知过去因，今生受者是，欲知未来果，今生作者是”这句话仍然会有人有点疑问，即南京大屠杀中被杀害的善良中国人（如前面所说的某甲）既然前世可能并没有对日本人造恶业，今世却无辜遭其屠杀，“今生受者”是被屠杀，根据这个“果”推出的“因”（中国人欠债）不对啊，至少是不完全对啊。其实这也好解释，佛教的文字都是方便说法，佛陀早就说过一切都是不可说，说过他自己四十九年并不曾说一字半语的佛法，他所说的一切只不过借助文字在行度化之方便，而文字表达出来的东西总是有局限的。“欲知过去因，今生受者是，欲知未来果，今生作者是”只不过是一种方便说一种简约说，让人们知道造了业肯定会受报的，在将来受报，“今生”是“过去”的将来，“未来”是今生的将来，佛教这种说法强调的是有因必有果，有业必受报的基本道理，如果死执文字，则成为印光大死所说的“凿死卯子汉”矣。
总而言之一句话：实事求是是佛家思想活的灵魂，碰到具体问题应该具体分析。